在整個人（rén）類曆史的發展進程中，疾病的（de）發生（尤其是瘟疫的發生）從未中斷過，而（ér）且動（dòng）物的疾病和人類的疾病也始（shǐ）終（zhōng）相互交錯發生著，近期發（fā）生的SARS和高致病性禽（qín）流感使得人類再次驚慌失措。個體（individual）醫學的研究幾乎已經到了巔峰階段，但群體（population ）醫學的研究依然顯得舉步維艱。問題的（de）症結到底在哪裏？此文將主要以豬病的（de）發生為例探（tàn）討疾病在群（qún）體中發生的根本原（yuán）因。
從二十世紀80年代開始，世界各地都在進行（háng）養豬生產模式變革的（de）實驗，其（qí）中涉及遺傳、育（yù）種、通風、豬（zhū）流（pig flow）、健康性能、欄舍麵（miàn）積、斷奶日齡、保育方式、室外（wài）飼（sì）養、豬群群體規模、斷奶-育成模式、上市（shì）決策製定，等等。在這些變革中，多點生產（Multi-loci/cite Production）和人工授精（Artificial Insemination，AI）的（de）影響極其重大，但這些（xiē）變革成功和失敗各幾何呢？其中（zhōng）不乏值得我們重新思考的地方。
1. 問題思考
以下將通過（guò）幾（jǐ）個問題（tí）的回顧來（lái）反思為什麽動物的（de）疾病和人的疫病變得越來越難以對付，以期給我們提供新的啟示。
1.1動物的飼養（yǎng）密度：眾（zhòng）所周知，亞洲之所以會成為（wéi）世界的流感中心（1957年、1968年、1997年和2003年亞洲和香港地區等發生禽流感（gǎn）和人（rén）流（liú）感），多數學者認為，其中（zhōng）最重要的（de）原因是亞洲人口密（mì）度大，動物和人群混居，尤其（qí）是豬和禽類近距離飼養。
在動物養殖業中，我們是否可以不再盲目提倡單（dān）位麵積的載畜量，而是強調單位動物的（de）空間擁有（yǒu）量，提（tí）倡動物福利。其實，養殖業現代化不是“現大化”，規模化也不（bú）是“高密度化（huà）”。
1.2動物（wù）的封閉（bì）飼養：人們總是（shì）以為隻要動物處在封閉（bì）的環境中，動物就會很少（shǎo）生病，但往往事與願違。雖然動物飼養環境越來（lái）越封閉（bì），但飼養業中（zhōng）被迫使用的抗生素種（zhǒng）類卻在不斷增加，使用的劑量也在不斷加大，人類的食品安全已經受到嚴重的威脅。
為了提高經濟效益，人們（men）一方麵將自己飼養的動物進行（háng）封閉，但一方麵又不斷從外麵（miàn）（尤其是國外）不斷（duàn）引進新的品種，動物群體的病原譜平衡就這樣一再（zài）被打破。
1.3 自然選擇和人工選擇（zé）發生（shēng）矛盾：自然（rán）選擇和人工選擇（zé）雖然同樣重要，沒有人（rén）工選擇，就不會有玉米（mǐ）、小麥和水稻，但自然選擇（zé）仍然（rán）是人工（gōng）選擇的基礎，所以沒有冬天（tiān）的水稻和夏天的小麥，我們不可違背自（zì）然選擇這樣一個基礎的規律。
在動物的飼養實踐中，人類為了追（zhuī）求動物的快速生長（zhǎng），不斷推進育種的進程（chéng）。飼養的動物（wù）（尤其是豬和（hé）雞）在人工的保護下（尤其是在藥（yào）物的保護下），雖然其生長速度越來越快，但抗病能力卻每況愈下。比（bǐ）如在豬的（de）選（xuǎn）育種上，人們過度追求瘦肉率，背膘雖（suī）然越（yuè）來越薄，眼肌麵積也越來越大，肌間脂肪含量（liàng）越來越低（dī），而豬的抗病能（néng）力越來越差，各種綜合征卻（què）接踵而來，如PRRS，PMWS，PDNS，PRDC，等等。
總之，遵從（cóng）自然的選擇（zé）是長久的，人為的過度幹預永遠是短命的。
凡此種種，都成了動物（wù）疫病周而複始的部分誘因，但動物疫病反複發生的內在規律是什麽呢？引起動物（wù）和人發生（shēng）疾病的（de）直接原因到底是什麽？曆史（shǐ）上的有識之士（shì）也曾提出了各種各樣的假定（Assumption）和假說（Hypothesis），這些假說對人類認（rèn）識疾（jí）病和控製疾病，尤其是對傳染病科學的認識起到了很好的推動作（zuò）用，但隨著人類對疾病（bìng）認識程度的加深（shēn），這些假說也越來越顯現出它們的局（jú）限性（xìng），比如Koch氏（shì）假說（shuō），Evans氏假說，自然疫源地的概念，無特定病原的概念，等等。
病原學理論已經到了必須充實變革（gé）的時候（hòu）了。
2. 病原譜（pǔ）差異性理論簡介（jiè）
病原學也叫病因學（Etiology），是一門（mén）研究疾病發生機（jī）理和規律的學科（kē）。
什麽叫病原（Pathogen）？ 凡是能夠引起動物（wù）和人正常生理機能改（gǎi）變的一（yī）切因素都應該稱為病原。其中包括：
① 細（xì）菌、真菌、放線菌、螺旋體、黴形體、立（lì）克次氏體、衣原體、病毒以及原蟲、蠕蟲（絛蟲、吸蟲、線蟲）和節肢動物等（děng）生物體；
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