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非洲(zhōu)豬瘟病毒流行株與基因缺(quē)失株鑒別檢(jiǎn)測規範

時間:2020-08-25    點擊: 次    來源:農業農村部    作者:畜(chù)牧獸醫局 - 小 + 大

本規範適用於(yú)非洲豬瘟病毒流行毒株與非洲豬瘟病毒CD2v和(hé)MGF 360-505R基因缺失株的熒光PCR方法鑒別檢測。

1.  主要試劑

1.1  核酸提取試劑(jì)盒。

1.2  無(wú)核酸酶水。

1.3  熒(yíng)光PCR預混液(yè)(2×)。

1.4  引物和探針(zhēn):P72、CD2v、MGF360-505R基因擴增引物和探針由國家非洲豬瘟(wēn)參考實驗室設計並提供(聯係人:李(lǐ)林,電話:0532-87839188)。 

1.5 陽性和陰性對照:陽性對照樣(yàng)品為ASFV基因組DNA標準物質(用無核酸酶水(shuǐ)稀釋1000倍後使用),由(yóu)國家非洲豬瘟參考實驗室(shì)提供;陰性(xìng)對照樣品(pǐn)為無核酸酶水(shuǐ)。

2.  主要儀器設備

2.1 熒光PCR擴(kuò)增儀。

2.2 台式低溫高速離心(xīn)機(jī)。

2.3 組(zǔ)織勻漿機。

2.4 微量可調移液器(2.5 μL、10 μL、100 μL、200 μL、1000 μL等不同規格)。

2.5 無核酸酶離心(xīn)管與吸頭(tóu)。

2.6  PCR擴增管。

3.  樣品采集和(hé)運輸保存

對活豬,可采(cǎi)集抗凝全血(xuè)(EDTA抗凝)、口鼻拭子或血清等;對病死豬或已屠宰豬,可采集脾髒、淋巴結、扁桃體、肝髒等組織。盡快送至實驗室進行病毒核酸檢測。

樣品(pǐn)的運送與保存應滿足(zú)NY/T 541《獸醫診斷樣品采集、保存與運輸技術規範》相關要(yào)求。上述樣品可在4°C最長保存2天;如需長時間保存,應置於-20°C以下(xià)。

4.  樣品處理

4.1  組織樣品

取0.1 g~0.2 g樣品,加入1 mL~2 mL預冷的(de)PBS(pH 7.4),用組(zǔ)織(zhī)勻漿機高速勻漿,製成10%組織勻漿液(yè),以5000 r/min離心(xīn)10 min,取200 μL上清液進行(háng)核酸提取。

4.2  液體樣品

抗凝全血、血(xuè)清等液體樣品不需進行特殊處(chù)理,直接取200 μL進行(háng)核酸(suān)提取。

5.  病毒核酸(suān)的提(tí)取和純化

取已(yǐ)進行前處理(lǐ)的樣品200 μL,可(kě)按傳統方法提取病毒核酸,也可采用病毒核(hé)酸提取試劑盒(hé)、自動化核酸提取儀提取病毒核酸。提取後的病毒核酸應立即使用或置於-20°C以下冷凍保存。每次抽提核酸,應包(bāo)括一(yī)個陽性對照(zhào)樣品和一個陰性對照樣品。

6.  熒光PCR檢測

6.1  熒光PCR反應液製備

在滅菌的離心管中製備符合檢測樣品數(shù)量(包括陽性、陰性對照)要求的(de)熒光PCR反應混合液,至少額(é)外製備兩個樣品(pǐn)的量。每個樣品配製20 µL PCR反應混合液,組成如下:7.5 mL P72、CD2v、MGF360-505R基因引物、探針(zhēn)預混液(P72、CD2v、MGF360-505R基因探針分別用FAM、VIC和Cy5進行標記)、12.5 mL 2×探針(zhēn)法熒光PCR預(yù)混液。

分別取20 µL PCR反應混合液加至每個PCR擴(kuò)增管中;再分別取(qǔ)5 µL DNA模板加入到PCR擴增管中。每次進行熒光(guāng)PCR擴增時均應設立陽性(xìng)、陰性對照。陽性對照應用陽性對照樣品所提取核酸作為模板,陰性對照應用陰(yīn)性對照樣品(pǐn)所提取核酸作為(wéi)模板。加入模板後,密封PCR擴增管,瞬時離心。將所有PCR擴增管放在熒光(guāng)PCR儀(yí)中。按下述條件運行擴增程(chéng)序。

6.2  熒光PCR擴增條件

50°C孵育(yù)2min;95°C預變性5min;95°C變性15s,60°C退火延伸1min,45個循環,在每一循環(huán)的60°C時收集(jí)FAM、VIC和Cy5通(tōng)道中的熒光信號。

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